Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hbb-bh2B2RVB7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms