Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rd3lB2RV38 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rd3lB2RV38 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms