Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc22a28B2RT89 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms