Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apol7aB2RT54 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apol7aB2RT54 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms