Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Otud4B2RRE7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otud4B2RRE7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms