Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms