Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm436B1AVU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm436B1AVU6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms