Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scml2B1AVB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scml2B1AVB3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms