Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Spocd1B1ASB6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spocd1B1ASB6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms