Protein–RNA interactions for Protein: B1ART2

Vps13d, Vacuolar protein sorting 13D, mousemouse

Predictions only

Length 4,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13dB1ART2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vps13dB1ART2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13dB1ART2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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