Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prr29B1ARI9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prr29B1ARI9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prr29B1ARI9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms