Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M5A7VMS3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M5A7VMS3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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H2-M5A7VMS3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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