Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930435E12RikA6X8Z9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930435E12RikA6X8Z9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms