Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp4A4UUI3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gbp4A4UUI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.2 ms