Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Odf2A3KGV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms