Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htra4A2RT60 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htra4A2RT60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms