Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4931406B18RikA2RSL7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4931406B18RikA2RSL7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms