Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtcflA2APF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtcflA2APF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms