Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc163A2AGD7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms