Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms