Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rbbp8nlA2ABX0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbbp8nlA2ABX0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms