Protein–RNA interactions for Protein: A2A654

Bptf, Bromodomain PHD finger transcription factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BptfA2A654 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BptfA2A654 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BptfA2A654 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BptfA2A654 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BptfA2A654 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BptfA2A654 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms