Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cul4bA2A432 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms