Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trav12-2A0N8N6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms