Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc173A0JLY1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms