Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms