Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms