Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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