Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JEU7

Ighv1-82, Immunoglobulin heavy variable 1-82 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ighv1-82A0A0G2JEU7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ighv1-82A0A0G2JEU7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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