Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv26A0A0B4J1P5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv26A0A0B4J1P5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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