Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv16A0A0B4J1H3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv16A0A0B4J1H3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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