Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5Q2

Ighv5-9, Immunoglobulin heavy variable 5-9 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-9A0A075B5Q2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ighv5-9A0A075B5Q2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms