Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Zfp607a-201ENSMUST00000053722 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Arpp21-230ENSMUST00000172380 3366 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cdk15-202ENSMUST00000160662 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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SrfQ9JM73 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cast-201ENSMUST00000065629 2910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Zwilch-201ENSMUST00000122091 2957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Heatr9-201ENSMUST00000019069 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Nipal4-201ENSMUST00000020679 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SrfQ9JM73 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
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