Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
OtofQ9ESF1 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.4 ms