Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Ccdc47Q9D024 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm38237-201ENSMUST00000193366 376 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc47Q9D024 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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