Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccdc18Q640L5 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Ccdc18Q640L5 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc18Q640L5 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Ccdc18Q640L5 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccdc18Q640L5 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc18Q640L5 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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