Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Serpinc1-202ENSMUST00000191936 725 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 CT025603.3-201ENSMUST00000224031 419 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 C6-201ENSMUST00000022788 2447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Dtna-201ENSMUST00000047954 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ceacam19-201ENSMUST00000052605 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Znf48Q3US17 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Znf48Q3US17 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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