Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm17908-201ENSMUST00000205552 1256 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Trafd1Q3UDK1 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms