Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Traf3ip1Q149C2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Smim15-202ENSMUST00000223808 808 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Traf3ip1Q149C2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms