Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Hoxd10P28359 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms