Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Pde6aP27664 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm14755-201ENSMUST00000118037 384 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Pde6aP27664 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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Pde6aP27664 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Pde6aP27664 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Pde6aP27664 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde6aP27664 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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