Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm45764-201ENSMUST00000213047 571 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxb2P0C1T1 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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