Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Ccl20O89093 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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