Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp9yF8VPU6 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp9yF8VPU6 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms