Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lrrc75aos1-201ENSMUST00000142492 779 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Usp29Q9ES63 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms