Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm6743-201ENSMUST00000117345 1066 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm15778-201ENSMUST00000118469 608 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccer1Q9CQL2 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms