Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Trim12aQ99PQ1 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Trim12aQ99PQ1 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms