Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Fetub-202ENSMUST00000116625 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Dsg1bQ7TSF1 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms