Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37924-201ENSMUST00000195470 3647 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NipblQ6KCD5 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Usf3-202ENSMUST00000119746 12708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm37457-201ENSMUST00000193639 2433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NipblQ6KCD5 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms