Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Ccdc18Q640L5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Uba1y-ps2-201ENSMUST00000190871 2544 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ccdc18Q640L5 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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